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Xu S, Zhao Q, Wei S, et al. Next Generation Sequencing Uncovers Potential Genetic Driver Mutations of Malignant Pulmonary Granular Cell Tumor[J]. Journal of Tho
发布日期:2016-02-19    分享:
文章解析

Next Generation Sequencing Uncovers Potential Genetic Driver Mutations of Malignant Pulmonary Granular Cell Tumor
 
背景
 
恶性颗粒细胞癌(GCTS)是临床中非常罕见的一种肿瘤,GCTs对于放化疗均不敏感。本文中陈军主任等针对之前由De Luca等人报道的一例获得性后纵膈GCTS病例,分享了一个天津总医院肺部肿瘤外科的恶性肺GCTS案例,并且通过二代测序技术揭示该案例的潜在分子机制。
案例简介
 
患者,女性,63岁,因持续数月的慢性咳嗽就医。经加强型胸部CT平扫显示左肺下叶有一个14×10×9cm大小的病灶,病理检测显示NSE(神经元特异性烯醇化酶)异常升高(67.41μg/liter, range, 0–16.3 μg/liter)。支气管镜活检后,经IHC检测确诊为GCT。患者接受了左肺叶全切以及系统淋巴结清扫。术中发现患者伴有胸膜转移,经术后IHC确认为肺部恶性GCT。
相关诊断信息
 
基因检测结果
 
为了进一步确认基因驱动突变,患者接受了燃石公司的295基因的OncoScreen检测,检测发现了NOTCH2、NOTCH4、PARP4、ASXL1以及AR共5个基因的7个突变,其中4个基因突变经过了一代测序的验证。
基因检测产品介绍
 


一次性全面检测295个明确报道与肿瘤高度相关的基因,覆盖了目前所有已上市及在研靶向药物的靶点基因及肿瘤12条信号通路中的关键基因,为患者寻找靶向治疗的所有线索。

包含MMR机制检测,适用于结直肠的PD1用药指导。

肿瘤样本和血液样本同时检测,分别报告体细胞突变与胚系突变,更准确地还原患者变异真实全景。

检测结果报告解读及用药指导
 
根据燃石医学的检测以及专业生物信息学分析结果,通过TCGA数据库比对我们发现,AR和Notch4的突变没有在任何肿瘤报道为somatic mutation,因此暂时不予考虑;ASXL1的缺失造成了ASXL1热点突变区域的移码突变;NOTCH2的A3错义突变发生在NOTCH2热点突变区域的下游,TCGA数据库中的多种肿瘤都报道过该突变;PARP4发生的三个突变在多种肿瘤也有报道,不过发生频率不高。 变异结果显示,该病例的基因驱动突变主要包括ASXL1、NOTCH2以及PARP4的相关变异,因此,PARP家族抑制剂或者NOTCH家族抑制剂可能使患者受益,具体的药物包括: veliparib、niraparib以及demcizumab,但是具体的临床治疗效果需要进一步证实。